师资队伍

蔡宇伽

长聘副教授、博导

 

电话: 34208571
传真:
邮箱: yujia.cai@sjtu.edu.cn
主页:

学习经历
2010年11⽉-2014年05⽉05⽇ 丹麦奥胡斯⼤学 博⼠学位 导师:Jacob G. Mikkelsen
2009年08⽉-2010年07⽉ 瑞典卡洛琳斯卡医学院 博士生 导师:Thomas Perlmann (现诺奖委员会秘书长)
2006年09⽉-2009年07⽉ 中国科学院研究⽣院 硕⼠学位
2002年09⽉-2006年07⽉ ⼭东⼤学 本科学位

 

工作经历
2017.11-至今, 上海交通大学, 系统生物医学研究院, 特别研究员
2016.3-2017.11, 丹麦奥胡斯大学, 博士后, 合作导师: Soren Paludan
2014.1-2016.2, 丹麦奥胡斯大学, 博士后, 合作导师: Jacob G. Mikkelsen

 

人才奖项
2023 “春申金字塔”卓越人才
2021 中组部万人计划青年拔尖
2018 上海市浦江学者

 

学会兼职与审稿人
学会和学术兼职:
欧洲基因与细胞治疗协会(ESGCT)会员。Nature Biotechnology、Gene Therapy杂志审稿人。Frontiers in Bioengineering and Biotechnology杂志客座主编。

社会兼职:
1. 2021年中国生物工程学会第七届科普工作委员会委员
2. 2020年参加上海东方卫视关于新冠疫苗的电视新闻直播
3. 2020年接受动脉网和DeepTech关于基因治疗创新药的专访
4. 2020参加百度直播间生物医药行业分析(50万+观看)
5. 2018年组织东方科技论坛-细胞与基因治疗论坛(大会主席)
6. 2018年参加澎湃新闻关于基因编辑婴儿事件的网络新闻直播

发现:利用CRISPR全基因组文库、单细胞测序等系统性工具发现药物新靶点和生物学新机制。
发明:发明新型基因编辑工具、新型递送载体、新型免疫治疗技术,实现遗传疾病、肿瘤、病毒感染等难治性重大疾病的治疗。
应用:将原创性的发现和发明用于临床治疗,开发全球意义的first in class药物。

Publication list (Yujia Cai)

2020-至今

1. Dendritic-cell-targeting virus-like particles as potent mRNA vaccine carriers, Nature BME, in press

2. Wei A#, Yin D#, Zhai Z#, Ling S#, Le H, Tian L, Xu J, Paludan SR, Cai Y*, Hong J*. In vivo CRISPR gene editing in patients with herpetic stromal keratitis. Molecular Therapy, 2023.

3. Sicong Lu and Yujia Cai*. Bacterial molecular syringe for drug delivery. Cell Host & Microbe 2023.

4. Di Yin#, Sikai Ling#, Dawei Wang#, Yao Dai, Hao Jiang, Xujiao Zhou, Soren Riis Paludan, Jiaxu Hong*, and Yujia Cai*. Targeting herpes simplex virus with CRISPR–Cas9 cures herpetic stromal keratitis in mice. Nature Biotechnology 2021.

5. Sikai Ling#, Shiqi Yang#, Xinde Hu, Di Yin, Yao Dai, Xiaoqing Qian, Dawei Wang, Xiaoyong Pan, Jiaxu Hong, Xiaodong Sun, Hui Yang, Soren Riis Paludan and Yujia Cai*. Lentiviral delivery of co-packaged Cas9 mRNA and a Vegfa-targeting guide RNA prevents wet age-related macular degeneration in mice. Nature Biomedical Engineering 2021.

6. Wang, D., K. Wang* and Y. Cai*. An overview of development in gene therapeutics in China. Gene therapy: 1-11. 2020.

7. Zhang B-c, Nandakumar R, Reinert LS, Huang J, Laustsen A, Gao Z-l, Sun C-l, Jensen SB, Troldborg A, Assil S, Berthelsen MF, Scavenius C, Zhang Y, Windross SJ, Olagnier D, Prabakaran T, Bodda C, Narita R, Cai Y, Zhang C-g, Stenmark H, Doucet CM, Noda T, Guo Z, Goldbach-Mansky R, Hartmann R, Chen ZJ, Enghild JJ, Bak RO, Thomsen MK, Paludan SR*. STEEP mediates STING ER exit and activation of signaling. Nat. Immunol; 21(8): 868-879. 2020.

2020前

1. Immunostimulatory guide RNAs mediate potent antiviral response; BioRxiv; Yujia Cai*, Alice Knudsen, Samuel Joseph Windross, Martin Kristian Thomsen, Søren Riis Paludan*. 2018.

2. Attenuation of cGAS-STING signaling is mediated by a p62/SQSTM1-dependent autophagy pathway activated by TBK1; EMBO J; 37(8); Prabakaran, T., C. Bodda., C. Krapp., B.C. Zhang., M.H. Christensen., C. Sun., L. Reinert., Y. Cai., S.B. Jensen., M.K. Skouboe., J.R. Nyengaard., C.B. Thompson., R.J. Lebbink., G.C. Sen., G. van Loo., R. Nielsen., M. Komatsu., L.N. Nejsum., M.R. Jakobsen., M. Gyrd-Hansen and S.R. Paludan*. 2018

3. In Vivo Knockout of the Vegfa Gene by Lentiviral Delivery of CRISPR/Cas9 in Mouse Retinal Pigment Epithelium Cells; Molecular therapy - Nucleic acids; 9: p. 89-99; Holmgaard, A., A.L. Askou., J.N.E. Benckendorff., E.A. Thomsen., Y. Cai., T. Bek., J.G. Mikkelsen and T.J. Corydon*. 2017

4. Inborn errors in RNA polymerase III underlie severe varicella zoster virus infections; J Clin Invest; 127(9): p. 3543-3556; Ogunjimi, B., S.Y. Zhang., K.B. Sorensen., K.A. Skipper., M. Carter-Timofte., G. Kerner., S. Luecke., T. Prabakaran., Y. Cai., J. Meester., E. Bartholomeus., N.A. Bolar., G. Vandeweyer., C. Claes., Y. Sillis., L. Lorenzo., R.A. Fiorenza., S. Boucherit., C. Dielman., S. Heynderickx., G. Elias., A. Kurotova., A.V. Auwera., L. Verstraete., L. Lagae., H. Verhelst., A. Jansen., J. Ramet., A. Suls., E. Smits., B. Ceulemans., L. Van Laer., G. Plat Wilson., J. Kreth., C. Picard., H. Von Bernuth., J. Fluss., S. Chabrier., L. Abel., G. Mortier., S. Fribourg., J.G. Mikkelsen., J.L. Casanova., S.R. Paludan* and T.H. Mogensen*. 2017

5. Targeted, homology-driven insertion in stem cells by ZFN-loaded 'all-in-one' lentiviral vectors; eLIFE; 5; Cai, Y., Laustsen, A., Zhou, Y., Sun, C., Anderson, M.V., Li, S., Uldbjerg, N., Luo, Y., Jakobsen, M.R. and Mikkelsen, J.G.* 2016

6. Lentiviral delivery of proteins for genome engineering; Current Gene Therapy; 16, E-pub ahead of print; Cai, Y. and Mikkelsen, J.G.* 2016

7. Lentivirus pre-packed with Cas9 protein for safer gene editing; Gene Therapy; 23(7), 627-633; Choi, J.G., Dang, Y., Abraham, S., Ma, H., Zhang, J., Guo, H., Cai, Y., Mikkelsen, J.G., Wu, H., Shankar, P., Manjunath N.* 2016

8. Targeted genome editing by lentiviral protein transduction of zinc-finger and TAL-effector nucleases; eLIFE; 3, e01911; Cai, Y., Bak, R.O. and Mikkelsen, J.G.* 2014

9. Driving DNA transposition by lentiviral protein transduction; Mobile Genetic Elements; 4, e29591; Cai, Y., Mikkelsen, J.G.* 2014

10. DNA transposition by protein transduction of the piggyBac transposase from lentiviral Gag precursors; Nucleic Acids Research; 10.1093/nar/gkt1163; Cai, Y., Bak, R.O., Krogh, L.B., Staunstrup N.H., Moldt B., Corydon T.J., Schr_der L.D., Mikkelsen J.G.* 2014

11. Efficient sleeping beauty DNA transposition from DNA minicircles; Molecular therapy - Nucleic acids; 2, e74; Sharma, N., Cai, Y., Bak, R.O., Jakobsen M.R., Schr_der L.D., Mikkelsen J.G.* 2013

12. A lentiviral vector-based genetic sensor system for comparative analysis of permeability and activity of vitamin D3 analogues in xenotransplanted human skin; Experimental Dermatology; 22, 178-183; Staunstrup, N.H., Bak, R.O., Cai, Y., Svensson, L., Petersen, T.K., Rosada, C., Stenderup, K., Bolund, L. and Mikkelsen, J.G.* 2013

1. 上海市 “创新行动计划”-细胞与基因治疗专项项目, 150万,2023.12-2026.11,在研,主持
2. NSFC面上项目,32370148,神经元特异限制性因子TMEFF1的抗病毒分子机制及衍生抗病毒肽药效研究,50万,2024.01-2027.12,在研,主持
3. 科技部重点研发项目,2022YFC3400205,拓展基因编辑技术的基础和应用研究场,2022.11-2027.10,143万,在研,骨干
4. 万人计划青年拔尖项目,BE4150003,基于类病毒体VLP-mRNA递送的新型疗法研究,2022.02-2025.01,180万,在研,主持
5. NSFC面上项目,31971364, 基于CRISPR文库发现的TMEFF1蛋白在神经元细胞内的抗病毒机制研究2020.01-2023.12,56万,在研,主持
6. 上海市浦江人才计划,18PJ1404500,开发新生儿X染色体连锁重症免疫缺陷症的基
因治疗技术,2018.07-2020.06, 20万,在研,主持
7. 上海市自然基金,18ZR1419300,利用高通量CRISPR文库筛选技术系统性发掘帕金
森病致病基因,2018.06-2021.05, 20万,在研,主持
8. 上海市卫计委协同创新集群项目 “重大疾病的干细胞治疗研发与临床转化体系建立” 2019-2023,4900万,在研,参与
9. 上海交通大学-上海本导基因技术有限公司,横向课题,40万,在研,主持
10. 上海交通大学-优秀人才培育项目,50万,在研,主持
11. 上海交通大学-生命科学学科群交叉重点项目,40万,在研,主持

CRISPR递送技术国家发明专利两项、PCT专利一项。

戴 瑶( 华东师范大学 硕士) 在读博士生
钟亦晔 (浙江大学 硕士)在读博士生
姜卓凡 (英国诺丁汉大学 硕士)在读博士生
张炳蔚 (北京师范大学 硕士)在读博士生
董兴啸(大连工业大学 硕士)在读博士生
孙炅明(上海交通大学 本科)直博生
张淑慧 (西安交通大学 本科)在读硕士生
陆斯瑽 (悉尼大学 本科)在读硕士留学生
张洛妮(西北农林科技大学 本科)在读硕士生
郭 钰(江南大学 本科)在读硕士生
王 婕 上海交通大学医学院 在读博士生(联合培养)

汤启昊 (上海交通大学) 本科实习生
汪啸渊 (上海海洋大学 本科)访问学生

毕业学生:
凌思凯(山东大学 硕士) 博士生(毕业)担任Biotech公司研发副总裁&合伙人
尹 笛(浙江大学 硕士)博士生(毕业)斯坦福大学博士后

毕业或在读博士生荣誉:交大优博论文2人次 (2021、2022年度唯一入围生物论文)、上海市优秀毕业生2人次、"学术之星"1人次 (交大最重要的研究生奖项之一)、国家奖学金2人次

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